实体肿瘤全景DNAseq(638基因)
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检测项目:
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检测方法:
DNA NGS
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检测内容:
638个靶基因:①SNV、InDel、常见融合;②靶基因CNV;③MSI、TMB、HLA分型、HRD和化疗药。
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临床意义:
◆ 辅助临床诊断:① AR基因扩增、突变或重排和/或AR剪接变体的激活与去势抵抗性前列腺癌(CRPC)相关;② GSTP1基因突变与TMPRSS2::ERG融合是前列腺癌发生最常见的改变;③ FLI1、SPOP、FOXA1或IDH1基因突变可见于前列腺癌;④ 同源重组修复 (HRR)、错配修复(包括BRCA1、BRCA2、ATM、CHEK2、FANCI、PALB2、MSH2)与转移性前列腺癌相关;⑤ MYC过表达、PTEN的丢失和TP53的失活与前列腺癌疾病进展有关; ◆ 指导靶向用药:① BRCA1/2突变的转移性去势抵抗性前列腺癌患者(mCRPC)可以从PARP抑制剂(如:奥拉帕利Olaparib、尼拉帕利Niraparib、他拉唑帕利Talazoparib、芦卡帕利Rucaparib)中获益,有HRR信号通路基因突变的患者可能对PARP抑制剂(如:奥拉帕利等)敏感;② AR基因改变对AR拮抗剂(如:恩杂鲁胺Enzalutamide、阿帕他胺Apalutamide、达罗他胺Darolutamide)敏感;③ CYP17基因改变对CYP17抑制剂(如:阿比特龙Abiraterone)敏感;④ NTRK1/2/3融合的前列腺癌患者对NTRK抑制剂(如:拉罗替尼Larotrectinib)敏感; ◆ 评估免疫治疗:① 一般认为TMB高的肿瘤可能产生更多的肿瘤新生抗原(Neoantigens)。TMB高的患者(TMB≥10muts/Mb)比TMB低的患者对PD-1/PD-L1免疫抑制治疗更加敏感;② MSI-H表型的晚期实体肿瘤倾向于从免疫检查点抑制剂疗法(PD-1/PD-L1抑制剂)中获益;③ HLA-I(HLA-A、HLA-B、HLA-C)杂合性与免疫治疗后生存期的增加相关,三个基因全部杂合的位点对免疫治疗更敏感。HLA-I杂合与TMB高的患者比单独TMB高的患者也具有更高的生存率; ◆ 遗传风险评估:① DNA损伤修复相关(特别是 BRCA2、BRCA1、ATM、PALB2、CHEK2、MLH1、MSH2、MSH6、PMS2)基因的胚系致病变异,提示家族遗传风险;② 帮助有肿瘤家族史的高危人群提早进行肿瘤发生风险的评估,提供早期的预防干预方案,降低患病风险;③ 对有家族遗传史或生育过患儿的并夫妇进行生育指导,有助于避免严重遗传病患儿的出生;④ 为临床实现精准的肿瘤个性化诊断及遗传咨询提供依据; ◆ 指导化疗用药:① 基于PharmGKB数据库,检测了2级及以上等级证据支持的化疗有关基因的SNP位点,预测化疗药物的毒性与有效性;② 在精准化疗之前,可进行化疗药物相关基因检测,从而制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。
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适用人群:
初诊、转移或复发肿瘤患者(尤其适合转移/复发/靶药耐药进展患者)。
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报告时间:
10个工作日
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样本类型:
石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子
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采集要求:
◆ 石蜡切片:10-15张,4-5μm厚,非粘附载玻片;或 ◆ 固定组织:穿刺组织不少于2条(长度≥5mm),或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm(黄豆大小),10%中性福尔马林固定;和 ◆ 胚系对照:外周血,EDTA抗凝,≥2ml;或 口腔拭子 ≥2根
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保存和运输:
室温(15-25℃)保存,48小时内送检