实体肿瘤全景DNAseq PLUS(638基因)
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检测项目:
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检测方法:
DNA NGS
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检测内容:
638个靶基因:①SNV、InDel、常见融合和CNV;②全基因组CNV&LOH;③MSI、TMB、HLA分型、HRD和化疗药;④AI肿瘤原发灶预测。
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临床意义:
◆ 辅助临床诊断:CTNNB1突变是WNT髓母细胞瘤的特征性改变;TP53、PTCH1、SMO、GLI2、TERT和SUFU基因突变常见于SHH亚型,其中根据TP53的状态划分为TP53突变型和TP53野生型;Group 3型髓母细胞瘤通常具有MYC扩增;Group 4型髓母细胞瘤通常具有MYCN和CDK6扩增; ◆ 确定分级分型:髓母细胞瘤都是WHO 4级,WNT 亚型常见改变包括6 号染色体单倍体、CTNNB1 基因突变等; ◆ 指导靶向用药:NTRK融合患者可能对其抑制剂(如:拉罗替尼Larotrectinib)敏感; ◆ 判定预后分层:WNT 亚型对术后放化疗敏感性最高,且最不易发生转移,因此预后也最好,CTNNB1被证实可以作为良好预后的标志物;SHH亚型的预后与Group 4相当,比Group 3预后好; ◆ 评估免疫治疗:TMB高的患者(TMB≥10muts/Mb)比TMB低的患者对PD-1/PD-L1免疫抑制治疗更加敏感;MSI-H表型的晚期实体肿瘤倾向于从免疫检查点抑制剂疗法(PD-1/PD-L1抑制剂)中获益; ◆ 遗传风险评估:对有肿瘤家族史的高危人群进行肿瘤风险评估;对育龄期女性进行生育指导; ◆ 指导化疗用药:检测化疗药物相关基因,制定个体化的化疗方案,以达到最大的化疗效果和最小的药物不良反应。
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适用人群:
初诊、转移或复发肿瘤患者。
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报告时间:
10个工作日
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样本类型:
石蜡切片/固定组织/外周血/口腔拭子
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采集要求:
◆ 石蜡切片:10-15张,4-5μm厚,非粘附载玻片;或 ◆ 固定组织:穿刺组织不少于2条(长度≥5mm),或 手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm(黄豆大小),10%中性福尔马林固定;和 ◆ 胚系对照:外周血,EDTA抗凝,≥2ml;或 口腔拭子 ≥2根
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保存和运输:
室温(15-25℃)保存,48小时内送检