肉瘤融合基因RNAseq
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检测项目:
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检测方法:
RNA NGS
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检测内容:
60个诱饵基因:包括已知(413对以上融合基因)和未知的融合基因。
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临床意义:
◆ 仅在DNA水平通过NGS技术检测融合,假阴性率较高;FISH、RT-PCR等方法,每次只能检测单个融合基因,无法发现新的融合突变;而基于全转录组的RNA-seq检测方法对样本质量要求较高,通常无法使用RNA质量较差的石蜡切片样本。但在RNA层面,利用靶向RNA NGS实现更精准、高效、低耗的融合基因突变检测,对肉瘤的分子分型、靶向用药、预后评估、遗传风险评估、化疗疗效预测和免疫治疗疗效预测等具有重大临床应用价值,精准辅助肉瘤患者的治疗指导和管理; ◆ 辅助临床诊断:① 在骨母细胞瘤和骨样骨瘤中均发现了FOS/FOSB重排。FOS的断点聚集在外显子4上,该外显子与其他基因的内含子或基因间区域融合。由此产生的转录物缺乏调控元件,类似于v-Fos逆转录病毒癌基因。在较小比例的情况下,检测到FOSB重排; ◆ 指导靶向用药:有助于找到突变的靶点及对应药物,实现异病同治; ◆ 发现未知融合:能够发现与60个基因发生融合的新伙伴基因,给患者带来新的希望,同时辅助科研探索。
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适用人群:
初诊、转移或复发肿瘤患者。
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报告时间:
10个工作日
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样本类型:
石蜡切片/固定组织
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采集要求:
◆ 石蜡切片:10-15张,5-10μm厚,病理级非粘附载玻片;或 ◆ 固定组织:穿刺组织不少于2条(长度≥5mm),或手术组织 0.5×0.5×0.5~1cm(黄豆大小),10%中性福尔马林固定
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保存和运输:
室温(15-25℃)保存,48小时内送检